quello individuato da giuly è un errore che è proprio meglio non commettere.
qualcuno non fa coincidere il n. della ft. con il protocollo (ma in realtà sarebbe meglio dire che tiene due distinte numerazioni: una per le ft. di vendita e l'altra per tutti i documenti registrati sul libro iva vendite) nei casi in cui si registrino sul libro iva vendite non solo le ft. di vendita ma anche i documenti per l'applicazione del meccanismo del reverse charge (autofatture, fatture integrate intracee, o per acquisto di oro industriale o argento puro, ecc.) Io però sono dell'idea che sia bene mantenere la stessa numerazione delle ft. di vendita anche in questi casi stante il disposto (seppur ambiguo) delle norme. Vedi per esempio l'art. 47 del D.l. 331/99.
Ciao