La contabilità separata dovrà essere adottata sicuramente nel caso di esercizio contemporaneo di imprese e professioni dato che le regole di determinazione dell'imposta sono diverse in relazione alla specifica attività.
Altri casi di obbligo riguardano lo svolgimento contemporaneo dell'attività di commercio al minuto con il metodo della ventilazione con altre attività, esercizio contemporaneo di attività agricole con detrazione forfettizzata con altre attività, attività spettacolistiche con detrazione forfetaria con altre attività.