Premesso che la mini-imu è da pagare solo se il comune ha applicato per l'abitazione principale un'aliquota superiore allo 0,40% e supponendo che sia il tuo caso, avresti dovuto effettuare un doppio conguaglio: uno con riferimento allo status dell'immobile (altra abitazione) per il periodo mar.-giu. con versamento entro il 16/12/2013 (anche qui però bisogna considerare se l'aliquota deliberata del comune per il 2013 è maggiore rispetto a quella del 2012) e l'altro con riferimento allo status di abitazione principale vigente per il periodo lug.-dic. con versamento della mini-imu entro il 24/01/2014.
In caso di non debenza della mini-imu (il comune non ha deliberato per l'abitazione principale un'aliquota superiore allo 0,40%) rimane solo l'ipotesi del conguaglio con versamento entro il 16/12/2013 come da me specificato.
Saluti.