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Si per territorialità, dovresti fare il reverse, che è una pippetta sensa senso solo formale, con il quale integri la ft fornitore calcolando l'iva 20% sul corrispettivo e la registr tra gli acquisti, poi la stessa la registri tra le vendite cosi le due ive si annullano e a te resta il solo debito verso il fornitore.
Guarda la nuova normativa IVA in vigore dal 2010, io la sto leggendo e studiando pian pianino, mi è sembrato di capire che questo sia uno dei casi particolari